Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3Q9Z2D8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms