Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn6Q9Z262 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn6Q9Z262 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn6Q9Z262 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn6Q9Z262 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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