Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nek4Q9Z1J2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek4Q9Z1J2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms