Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Skp2Q9Z0Z3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Skp2Q9Z0Z3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms