Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV84

Nme4, Nucleoside diphosphate kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme4Q9WV84 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Nme4Q9WV84 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms