Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Wdr54Q9R0D8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Wdr54Q9R0D8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms