Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gpc6Q9R087 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gpc6Q9R087 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gpc6Q9R087 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gpc6Q9R087 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gpc6Q9R087 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gpc6Q9R087 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gpc6Q9R087 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gpc6Q9R087 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gpc6Q9R087 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gpc6Q9R087 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gpc6Q9R087 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gpc6Q9R087 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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