Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnt3Q9QZ47 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnt3Q9QZ47 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms