Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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