Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim44Q9QXA7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Trim44Q9QXA7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim44Q9QXA7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim44Q9QXA7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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