Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Csnk1eQ9JMK2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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