Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col5a3Q9JLI2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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