Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tlr5Q9JLF7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tlr5Q9JLF7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tlr5Q9JLF7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tlr5Q9JLF7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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