Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Habp4Q9JKS5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms