Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Wdr61Q9ERF3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Wdr61Q9ERF3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms