Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem43Q9DBS1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms