Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SrpraQ9DBG7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms