Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TrmuQ9DAT5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.2 ms