Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.6 ms