Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Q9D8N1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms