Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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