Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms