Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn22Q9D7U6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cldn22Q9D7U6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cldn22Q9D7U6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cldn22Q9D7U6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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