Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nop56Q9D6Z1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Nop56Q9D6Z1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Nop56Q9D6Z1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nop56Q9D6Z1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nop56Q9D6Z1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nop56Q9D6Z1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nop56Q9D6Z1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nop56Q9D6Z1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nop56Q9D6Z1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nop56Q9D6Z1 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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