Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc9bQ9D6E4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms