Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc7Q9D541 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc7Q9D541 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc7Q9D541 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc7Q9D541 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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