Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Snx20Q9D2Y5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Snx20Q9D2Y5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms