Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms