Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mrpl28Q9D1B9 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Mrpl28Q9D1B9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms