Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9D131 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9D131 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9D131 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9D131 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9D131 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9D131 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9D131 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9D131 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9D131 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9D131 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9D131 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9D131 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9D131 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9D131 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9D131 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9D131 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q9D131 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Q9D131 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Q9D131 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms