Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SdhdQ9CXV1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms