Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nip7Q9CXK8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nip7Q9CXK8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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