Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ddx28Q9CWT6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ddx28Q9CWT6 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ddx28Q9CWT6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ddx28Q9CWT6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ddx28Q9CWT6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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