Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NubplQ9CWD8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms