Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Fcf1Q9CTH6 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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