Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snw1Q9CSN1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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