Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q9CRC3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms