Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim8Q9CQQ0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms