Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdm1Q9CQK3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdm1Q9CQK3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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