Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nudt21Q9CQF3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nudt21Q9CQF3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms