Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Atp6v0e1Q9CQD8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Atp6v0e1Q9CQD8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Atp6v0e1Q9CQD8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Atp6v0e1Q9CQD8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp6v0e1Q9CQD8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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