Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prpf8Q99PV0 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Prpf8Q99PV0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms