Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsnaxip1Q99P25 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms