Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubqln4Q99NB8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubqln4Q99NB8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubqln4Q99NB8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubqln4Q99NB8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ubqln4Q99NB8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ubqln4Q99NB8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ubqln4Q99NB8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ubqln4Q99NB8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ubqln4Q99NB8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ubqln4Q99NB8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ubqln4Q99NB8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubqln4Q99NB8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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