Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdac9Q99N13 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac9Q99N13 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms