Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SrrtQ99MR6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms