Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atp1b4Q99ME6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms