Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nus1Q99LJ8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms