Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sh3bp5lQ99LH9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sh3bp5lQ99LH9 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms