Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TriobpQ99KW3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TriobpQ99KW3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TriobpQ99KW3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TriobpQ99KW3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TriobpQ99KW3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TriobpQ99KW3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TriobpQ99KW3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TriobpQ99KW3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TriobpQ99KW3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TriobpQ99KW3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TriobpQ99KW3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TriobpQ99KW3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TriobpQ99KW3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TriobpQ99KW3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TriobpQ99KW3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TriobpQ99KW3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms